作为国内核苷（酸）类医药中间体研发和生产企业，公司一贯重视环境保护工作，持续投入资金进行环保升级改造，坚决执行“三同时”政策，坚持技术革新和设备升级，从源头上减少污染物排放的同时下大力气进行末端治理，不仅做到达标排放，同时力争做到超低排放。
环保管理和执行
公司制定了较为完善的环境保护管理制度以及相关的检验规程和操作规程，并得到了有效的贯彻和执行。公司安全环保部下设环保处、污水处理站。环保处主要负责监督生产部门及辅助部门的日常环境保护（主要是大气污染物）情况，落实新的环保政策、标准、文件以及市、县各级主管部门通知的贯彻与实施。污水处理站主要负责公司生产污水、生活污水的收集、处理，进行全过程跟踪化验，并保证污水处理设施正常运转、污水达标排放。
环保认证和荣誉
拓新药业及其子公司新乡制药已按照相关法律法规要求取得了《排污许可证》。公司建立了环境管理体系，已通过iso14001环境管理体系认证。2019年，新乡市生态环境局根据《河南省企业事业单位环保信用评价管理办法》对本公司及子公司新乡制药进行了考察评定，根据过往环境守法情况，认定本公司及子公司新乡制药均属于环保诚信单位。同时，在河南省制药行业绿色发展协会组织的2019年下半年河南省医药行业绿色发展调研评价活动中，本公司及子公司新乡制药分别位列行业第八名和第三名。
清洁生产审核验收
2020年6月5日，河南省生态境厅在新乡市主持召开了拓新药业清洁生产审核验收会，并形成《清洁生产审核验收专家意见表》，确认通过实施各项清洁生产方案，公司取得了一定的环境、社会和经济效益，确认公司清洁生产达到了国内先进水平；依据国家《清洁生产审核评估与验收指南》，专家组认为拓新药业本轮清洁生产审核验收合格。
未来环保计划
另外公司计划继续对厂区废气治理系统进行升级改造，在 rco 与活性炭吸收装置基础上再增加一套增加rto 装置，进一步削减污染物的排放量；子公司新乡制药计划搬迁至延津县厂区进行生产，延津县厂区有机废气拟采用前端多级处理 末端先进的 rto 处理装置，将极大的削减单位产品污染物的排放量。
